单细胞测序公共数据库

2023-09-01 15:22:52 编辑:admin 阅读:
导读怎么将测序的micrna数据传到公共数据库 怎么将测序的micrna数据传到公共数据库NCBI:持有INSDC的节点。网站上有核酸、蛋白、基因名、基因组名等等的搜索工具,以及BLAST序列比对搜索工具,PUBMED文献数据库,Taxonomy数据,COG蛋白家族库等等。FTP可以下到它全部的数据库,BLAST的单机程序,以及各种工具程序。 有没有提取单细胞的设备? 有

怎么将测序的micrna数据传到公共数据库

怎么将测序的micrna数据传到公共数据库NCBI:持有INSDC的节点。网站上有核酸、蛋白、基因名、基因组名等等的搜索工具,以及BLAST序列比对搜索工具,PUBMED文献数据库,Taxonomy数据,COG蛋白家族库等等。FTP可以下到它全部的数据库,BLAST的单机程序,以及各种工具程序。

有没有提取单细胞的设备?

有,CTC细胞单细胞提取目前有这样的设备,而且是活细胞,扩展到有核红细胞等应该也是可行的。该设备是用晶体硅制造的单细胞漏斗实现的。

为什么大部分单细胞测序测3'utr

细胞是生物学的基本单位,研究人员正更加努力地尝试将它们进行单个分离、研究和比较。单细胞测序是指DNA研究中涉及测序单细胞微生物相对简单的基因组,更大更复杂的人类细胞基因组。随着测序成本的大幅度下降,破译来自单细胞的30亿碱基的基因组并逐个细胞比较序列正在变为现实。目前,最常见的单细胞测序的应用是在肿瘤研究上。来自美国和英国的研究人员近日利用单细胞基因组扩增、测序和装配,从海洋样本中鉴定出一个单细胞细菌。

10x genomics单细胞转录组为什么只能获得3'端转录本信息

要看情况,总体的测序深度是否够高,如果某个基因或转录本的reads数目仅有1-2条,我们一般认为其确实存在,但是表达量无法准确估计。所以在下结论的时候一般以readscount;1的认为有表达,但是以FPKM;1为可信的表达量,低于该值的表达量可能是不

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